作为双歧杆菌的食料，大豆低聚糖最显著的一点就是快速增殖双歧杆菌。有试验证明，成年人每天摄入10g大豆低聚糖，一周后每克粪便中的双歧杆菌数增加20%，同时肠内双歧杆菌发酵低聚糖时能产和一些抗菌素，可抑制外源致病菌和肠内固有腐败细菌的生长繁殖。大豆低聚糖的摄入可有效地减少发酵产物及有害细菌的产生，每天摄入10g大豆低聚糖，3周之内即减少44.6%有毒发酵产物和40.9%有害细菌酶的产生，起到排毒、养颜之功效。同时能刺激肠道蠕动，保持一定的渗透压，并抑制病源菌，消除肠道菌群紊乱，恢复原有平衡，从而达到治疗便秘和腹泻的目的。
提高免疫力，增强抗癌力
双歧杆菌能杀灭致癌物N-亚硝酸胺。双歧杆菌及其代谢产物能通过诱异产生干扰素和促细胞分裂剂，活化NK细胞并促进免疫球蛋白抗体的产生，从而活化巨噬细胞的功能，提高机体免疫力，增强对癌症的抵抗能力。
不产生能量，是减肥者和糖尿病人的首选
大豆低聚糖很难或不被人体消化吸收，所提供的能量值很低或根本没有，故可在低能量食品中发挥作用，最大限度地满足了那些喜爱甜品又担心发胖者的要求，还可供糖尿病人、肥胖病人和低血糖病人食用。有利于预防和改善冠状动脉硬化造成的心脏病。
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